Phân tích định lượng tình trạng methyl hóa DNA toàn hệ gene trên khối u tuyến yên

Phân tích định lượng tình trạng methyl hóa DNA toàn hệ gene trên khối u tuyến yên

Methyl hóa DNA là một trong những biến đổi epigenetic liên quan tới quá trình phát sinh khối u. Trong nghiên cứu này chúng tôi sàng lọc trạng thái methyl hóa của 27,578 điểm CpG thuộc 14,495 genes trong 4 subtypes khối u tuyến yên và đối chiếu với mô lành. Kết quả sàng lọc bước đầu bằng kỹ thuật Infinium 27K array đã xác định được 55 genes có tình trạng methyl hóa bất thường ở khối u. Tiếp theo, tính chính xác của lượng lớn dữ liệu sàng lọc được xác nhận lại bằng pyrosequencing. Kết quả cho thấy 12/16 genes (75%) có sự tương đồng giữa 2 kĩ thuật. Tần suất mythyl hóa bất thường của 12 genes trên 13 khối u tuyến yên subtype bất hoạt chức năng (non-functioning) dao động từ 2/14 (gene COL1A2) cho tới 12/13 (gene HHIPL1 và TFAP2A). Dữ liệu qRT-PCR cho thấy tình trạng methyl hóa DNA vùng promoter của 3/12 genes (EML2, ROHD, và HOXB1) có mối liên hệ tương quan ngược với biểu hiện genes ở mức phiên mã. Đây là nghiên cứu đầu tiên về tình trạng methyl hóa trên toàn hệ methylome ở khối u tuyến yên. Kết quả này cung cấp các genes ứng viên cho các nghiên cứu tiếp theo về ung thư.

Nghiên cứu này do NCS Dương Văn Cường, giảng viên khoa CNSH&CNTP thực hiện tại Đại học Keele, Anh Quốc và được công bố trên tạp chí Endocrine-Related Cancer. Nếu bạn đọc quan tâm và cần trao đổi mời liên hệ với tác giả theo địa chỉ email duongvancuong1980@yahoo.com

http://erc.endocrinology-journals.org/content/early/2012/10/08/ERC-12-0251.abstract